“那位先生”
姓名：不详
简述：“那位先生”即组织内成员对黑组织首领的称呼。黑组织首领的身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未露面或者有过一个剪影。现在唯一可以知道的是，组织的首领手机号码在鸟取县(TV387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(尾奏曲))。据说作者青山刚昌曾经在2006年的一次访谈中指出组织的首领其实是之前的漫画中出现的人物，由此产生了一些猜测。
代号：琴酒 (GIN)
姓名：不详
简述：琴酒是组织中最早出现的人物，Vodka的大哥，新一就是被他从背后打倒，再灌下了毒药APTX4869。有着冷酷的眼神，杀过许多人也不在乎的样子，在组织里似乎有极高的地位，只要达到他的地位就可以见到“那位先生”，主要负责很危险的暗杀和重要交易。和雪莉似有很深的关系，是个智能型的罪犯，和柯南多次交手都未曾吃亏。有一辆从德国买来的黑色保时捷，型号是356A。
声优：堀之纪
初登场：001 云霄飞车杀人事件
代号：伏特加(Vodka)
姓名：不详
简述：琴酒的助手，也是早期登场的人物。Vodka长的非常壮，头脑简单，遇事没有主见，做事稍嫌不细密，全听Gin的，称琴酒为「老大」。有几次几乎上了柯南的当而暴露组织的情况，幸由琴酒发现而得以弥补。
声优：立木文彦
初登场：TV 001 云霄飞车杀人事件
代号：苦艾酒（Vermouth 也有译为贝尔摩德）
姓名：克莉丝·温亚德
职业：演员
擅长：易容、射击
名言：A secret makes a woman woman
简述：组织重要人物之一，深受组织“那位先生”的宠爱。曾化装成克莉丝·温亚德，美国著名女演员和其母亲莎朗以及兰学校的新出医生，时而复出，时而隐退，行迹与想法都无法掌握猜度，精通易容术，真实身份应该是其母亲莎朗，可能也吃过APTX4869。二十年前杀死FBI探员朱蒂的父母，留下了一个带有指纹的眼镜，并因此而暴露身份。曾经帮过黑暗组织的一名成员Pisco一回，一直在追查组织的叛徒雪莉，身手、智慧都堪与和琴酒媲美，大概还在其上。种种诡异的举动总是能让人感到不寒而栗，但是对柯南和小兰又极力的保护，似乎有叛变组织的倾向。
声优：小山茉美
初登场：TV 176-178 与黑暗组织的再会
代号：龙舌兰(Tequila)
姓名：不详
简述：组织人物之一，在一次交易中因拿错箱子被炸死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
初登场：TV 054 电玩公司杀人事件
代号：皮斯克(Pisco)
姓名：枡山宪三
年龄：71岁
职业：汽车公司董事长
简述：组织人物之一，原名枡山宪三，身为汽车公司老板的他是经济界的巨子，同时也是为组织长年工作的老成员。他是宫野志保的父亲宫野厚司的好友。与组织老大关系密切，在漫画《背叛的街角》中，哀悼会上举枪射杀目标人物时被在场记者拍到。因此被琴酒所杀。
初登场：176-178 与黑暗组织的再会
代号：卡尔瓦多斯(Calvados)
姓名：不详
简述：组织人物之一，似乎是Vermouth的助手，头次出场就被赤井秀一打断双腿然后自杀了，真是个倒霉的家伙，连个面都没露，连句话都没说出来……不过在2006年的SP TV425 黑色冲击！组织墨爪伸来的瞬间 中，在组织成员的回忆中出现过一个剪影，大约是一个戴眼镜的瘦高个子。
初登场：345 和黑暗组织一决胜负 满月之夜的二元推理
代号：雪莉(Sherry)
姓名：宫野志保
简述：组织科学家宫野厚司的次女。美国留学后在组织里负责开发APTX4869，是组织里的“红人”（琴酒语）。但在组织杀害她的姐姐宫野明美后放弃研制作为抗议。在被组织处决前服下APTX4869自杀，却变回小孩并逃出组织。现在化名灰原哀住在阿笠博士家中，和柯南一起生活并躲避组织的追杀。曾经在一次哀悼会中被皮斯克认出，并在短暂变回宫野志保后被琴酒枪击。多亏得到柯南的帮助才得以逃出。
初登场：TV 129 来自黑暗组织的女子
声优：林原惠美
代号：基尔(KIR)
姓名：本堂瑛海
化名：水无怜奈
简述：CIA特工，为破坏组织而打入内部。她的父亲伊森。本堂也是侦办组织的CIA特工，在女儿身份暴露后自杀，并伪造成审问基尔却反被她所杀的假象，使本堂瑛海躲过了组织的怀疑并得到“那位先生”的信任。她平时的身份是日卖电视台的主持人。在一次暗杀政要的行动中因为事故被FBI当作组织成员擒获，并一直在医院伪装昏迷。直到她“苏醒”后FBI才知道她的真实身份，并且将她送回组织继续完成任务。但在刚回去不久时，在琴酒的要求下杀死了赤井秀一。不过很多人怀疑这只是做给琴酒的戏而已。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：三石琴乃
代号：基安蒂(Chianti)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，据说有狙击600码外目标的能力。因为苦艾酒的行动害死了卡尔瓦多斯，对她非常反感。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优： 井上喜久子
代号：科恩(Korn)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，和基安蒂是搭档。似乎和之前死去的卡尔瓦多斯关系很好。同样反感苦艾酒
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：木下浩之
姓名：邵渊己一郎
简述：组织底层人物之一，组织的一员，是末端的末端的人物。组织教他一系列的杀人手法，以协助优秀的杀手作案。但是他达不到预期的培养效用， 就被送到宫野志保处来作实验对象。后来在作人体实验前逃跑。后被警察逮捕判了死刑。
初登场：TV 118 浪花连续杀人事件
姓名：宫野 厚司
简述：宫野志保的父亲，科学家。在科学界以“被业界驱逐的疯狂科学家”而知名。在发表会类的活动中遇到过阿笠博士，并表示过对阿笠博士的发明的兴趣，是个相当直爽的人。在组织中与妻子一起进行“使死者复活的秘密药物”的研究，在实验中因事故死亡（根据组织的报告）。在《夕阳染红的女儿节人偶》中被小哀提到。
姓名：宫野 艾理娜
简述：宫野志保的母亲，被称为“Hell Angel”，可能是英国人。从英国到日本留学时遇到厚司，此后结婚。性格忧郁阴沉，小哀的阴沉是她的遗传？与丈夫一同死亡。还有很多未可知之处，但是从留给女儿的录音带中可以了解到她其实很关心小哀。 在《金钱买不到的友情》中被博士提到。
姓名：宫野明美
化名：广田雅美
简述：宫野志保的姐姐，黑暗组织的基层成员。参与了黑暗组织10亿元抢劫案，得手后因背叛组织被琴酒所杀。和妹妹志保不同，因为是基层成员，所以可以像正常人一样生活，但其实是在组织的监控下。是为了让志保脱离组织，作为交换条件，才加入组织的。为了逃避组织的追查，自己有一间秘密住所，但在死后被琴酒发现。
初登场：TV 128 黑衣组织10亿元抢夺事件
声优：玉川纱己子
“那位先生”（あの方）BOSS
姓名：不详
性别： 男
年龄：不详
简述：“那位先生”即组织内成员对黑衣组织首领的称呼。但黑衣组织首领的身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未以组织首领的身份露面或者有过一个剪影。现在已知他所“宠爱的女人”（GIN语）是苦艾酒。此外，在425 Black impact ！被组织的魔掌触碰的瞬间中曾提到，他下令苦艾酒协助暗杀任务。而且，组织的首领手机号码在鸟取县（TV387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音 尾奏曲 ）中由于苦艾酒的电话被窃听，从而得知，但因其危险性，被哀劝阻，所以柯南并没有拨打此号码。据说作者青山刚昌曾经在2006年的一次访谈（《朝日新闻》2006年1月13日晚刊）中指出组织的首领其实是之前的漫画中出现的人物，并得到了大部分柯南迷的支持，且由此产生了一些猜测。
初登场：未知，存在是否已登场的疑问
琴酒 （GIN ジン）
姓名： 黑泽阵(在'‘人鱼失踪记’'和漫画中曾出现）(猜测）
性别：男
年龄：28-38(预测）
简述：琴酒是组织中最早出现的人物，Vodka的大哥，新一就是被他从背后打倒，再灌下了毒药APTX4869。他的年龄、国籍和真名都是一个谜。永远都是一身黑色长风衣，黑色的帽沿下披散的银色长发，和一张总是那样邪恶的脸。残酷无情，极度冷静，有着冷酷的眼神，右眼闪着寒光，杀过许多人也不在乎的样子，在组织里似乎有极高的地位，只要达到他的地位就可以见到“那位先生”，主要负责很危险的暗杀和重要交易。和雪莉似乎有很深的关系，是个智能型的罪犯，和柯南多次交手都只吃过一次亏（M13 柯南用灯罩【而这个灯罩是被直升机扫射时击中，掉在柯南身边的】把他乘坐的直升飞机打了下来）。有一辆从德国买来的黑色保时捷，型号是356A，左撇子。貌似被贝尔摩德喜欢，但具体暧昧情节在动画版中删掉了。
劲敌： 赤井秀一(已失踪或已死亡)、工藤新一(江户川柯南)
声优：堀之纪
初登场：漫画：Vol。1 File。1 《平成的福尔摩斯》TV：001 云霄飞车杀人事件
苦艾酒（Vermouth ベルモット 也有译为贝尔摩得（贝尔摩德，贝尔茉）
姓名：莎朗·温亚德（Sharon Vineyard）、克莉丝·温亚德（Chris Vineyard，是通过易容分别演出，与莎朗是母女）
年龄：看起来是29岁（其真正年龄到目前也是一个谜）
职业：演员
擅长：易容、射击、变声
名言：A secret makes a woman woman。(秘密使女人更有女人味 )
简述：组织重要人物之一，长得相当漂亮，头脑冷静，判断力强，是组织中相当有实力的人，地位仅次于“那位先生”。公开身份是美国著名女演员，是工藤有希子的好友。习惯于单独行动。深受组织“那位先生”的宠爱。曾化装成莎朗的女儿克莉丝·温亚德以及小兰学校的新出医生，时而复出，时而隐退，行迹与想法都无法掌握猜度，精通易容术，真实身份应该是莎隆·。温亚德，纽约事件中变装成银发杀人犯。把赤井秀一的存在视为银色子弹的危险。头脑好、枪法高明。在组织中负责收集重要的情报。她还是组织BOSS所中意的人。变装成新出老师、刺探出宫野志保（灰原哀），然后除之。好像非常痛恨宫野志保的双亲所研究的东西。可能也吃过APTX4869。二十年前杀死FBI探员朱蒂的父母，留下了一个带有指纹的眼镜，并因此而暴露身份。曾经帮过黑暗组织的一名成员皮斯克一回，一直在追查组织的叛徒雪莉，身手、智慧都堪与和琴酒媲美，大概还在其上。种种诡异的举动总是能让人感到不寒而栗，但是对柯南和小兰又极力的保护（原因是出于在先前的事件中被小兰和新一救过一次，出自于TV版 第345话 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案中对于过去的回忆，并且发现柯南就是新一，灰原哀就是宫野志保，但未告知琴酒等人），似乎有叛变组织的倾向。
声优：小山茉美
初登场：漫画：Vol。24 File。8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
伏特加（Vodka ウォッカ）
姓名：不详
性别：男
年龄：不详
简述：琴酒的助手，也是早期登场的人物，GIN的贴身助手兼司机。新一当时便是目睹了他和不名男子的交易。Vodka长的非常壮，头脑简单，遇事没有主见，做事稍嫌不细密，全听琴酒的，尊称琴酒为「大哥」。有几次险些中了柯南的计而暴露组织的情况，幸由琴酒发现而得以弥补。
声优：立木文彦
初登场：漫画：Vol。1 File。1 《平成的福尔摩斯》TV：001云霄飞车杀人事件
雪莉（Sherry シェリー）
姓名：宫野志保
化名：灰原哀
年龄：18岁（Sherry自称）
简述：组织科学家宫野厚司的次女。美国留学后在组织里负责开发APTX4869，是组织里的“红人”（琴酒语）。但在组织杀害她的姐姐宫野明美后放弃研制作为抗议。在被组织处决前服下APTX4869自杀，却变回小孩并逃出组织。现在化名灰原哀住在阿笠博士家中，和柯南一起生活并躲避组织的追杀。曾经在一次哀悼会中被皮斯克认出，并在短暂变回宫野志保后被琴酒枪击。多亏得到柯南的帮助才得以逃出。 后来在动画345中身份暴露，被Vermouth发现。但是至今为止不为Gin等其他成员所知。
初登场：漫画：18卷之FILE。6 《转学生》 TV ：129 来自黑暗组织的女子
声优：林原惠美
其他成员
龙舌兰（Tequila テキーラ，死亡）
姓名：不详
简述：组织人物之一，关西口音的大汉，在一次在和满天堂公司职员交易的时候因拿错箱子在与GIN通话时被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
初登场：漫画：Vol。12 File。4 《突如其来的遭遇》TV：054 电玩公司杀人事件
声优：广田行生
匹斯可（Pisco ピスコ，死亡）
姓名：枡山宪三（升山绘三）
年龄：71岁
职业：汽车公司董事长
简述：组织人物之一，原名枡山宪三，身为汽车公司老板的他是经济界的巨子，同时也是为组织长年工作的老成员。他是宫野志保的父亲宫野厚司的好友，所以经常能听到一些开发中的药物的事情。与组织老大关系密切，封住有受贿嫌疑问题的政治家吞口重彦口的人。暗杀宫野志保失败。之后在漫画《背叛的街角》中，哀悼会上举枪射杀目标人物——另一组织成员吞口重彦时被在场记者拍到。因过多的失败，被琴酒所杀。
初登场：漫画：Vol。24 File。8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
声优：村松康雄
卡尔瓦多斯（Calvados カルバドス，死亡）
姓名：不详
简述：组织人物之一，似乎是苦艾酒的助手，是个枪法很准的狙击手。所持来福枪、手枪、猎枪等各种武器。最喜欢用的是来福枪。原因：直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件中，贝尔摩得说“用你最爱的来福枪……”。头次出场带着3把枪，之后就被赤井秀一打断双腿。然后在自己被捕前自杀了。真是个倒霉的家伙，连个面都没露，连句话都没说出来……不过在2006年的SP TV425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间 中，在组织成员chianti和korn的回忆中出现过一个剪影，大约是一个戴眼镜的瘦高个子。
初登场：漫画：File。433 《面具下的真相》TV：345 直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件
基安蒂（Chianti キャンティ）
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，狙击上限为650yard。因为苦艾酒的行动害死了卡尔瓦多斯，对她非常反感。
初登场：TV： 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优： 井上喜久子
科恩（Korn コルン）
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，和基安蒂是搭档，射击能力也与她不相上下。似乎和之前死去的卡尔瓦多斯关系很好。同样反感苦艾酒。
初登场：TV：425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：木下浩之
波本（Bourbon バーボン）
姓名：不详
简述：谜一样的组织成员，对他的认识之少可以说仅次于那位先生。最早的“登场”来自于水无怜奈在返回组织后给FBI的一通电话中。水无怜奈提到组织为寻找雪莉而派出了强大的侦探。这名侦探很可能是组织高层人物，但是连水无怜奈也没有听说过，而他的代号就是波本（Bourbon ，一种烈性美国威士忌）。在随后的漫画中，可以感受到波本已经出现在柯南的周围。但并没有被明确地指出。有人认为赤井秀一死后忽然出现的大学生冲矢昴就是波本，因为冲矢昂暂住在新一家里，在TV511中最后他有喝Bourbon，而且露出神秘的笑，但他也可能是赤井秀一假扮的。也有人猜测，失踪后又再次出现的秀一才是真正的波本。因此，这个人物虽然应该已经出现过了，但他究竟是谁还是一个谜。
初登场：TV：509 红白黄色与侦探团
代号：未知
宫野厚司（死亡）
简述：宫野志保的父亲，科学家。在科学界以“被业界驱逐的疯狂科学家”而知名。在发表会类的活动中遇到过阿笠博士，并表示过对阿笠博士的发明的兴趣，是个相当直爽的人。在组织中与妻子一起进行“使死者复活的秘密药物”的研究，在实验中因事故死亡（根据组织的报告）。在《夕阳染红的女儿节人偶》中被小哀提到。
代号：未知
艾莲娜·宫野（宫野エレーナ 死亡）
简述：宫野志保的母亲，可能是英国人。从英国到日本留学时遇到厚司，此后结婚。虽然跟阿笠博士见过面，但因为其寡言少语，所以留下了不知道在想些什么的印象。虽然在组织中被称为地狱的坠落天使（HELL ANGEL），但把录有自己声音的录音带委托给宫野明美交给女儿志保。录音带里反映出其对女儿志保的事情非常重视的想法。性格忧郁阴沉，小哀的阴沉是她的遗传？与丈夫一同死亡。还有很多未可知之处，其真实身份也是个谜，但是从留给女儿的录音带中可以了解到她其实很关心小哀。在《金钱买不到的友情》中被博士提到。
声优：铃木弘子
爱尔兰IRISH（死亡）
姓名：不详
简述：M13黑衣组织派去警视厅的内奸，Vermouth帮其易容成松本警视。因GIN杀害尊敬如父的匹斯可，在得知柯南真实身份后并未告诉GIN，想抓住柯南去见那位先生，来扳倒GIN……最后为了救柯南死于“基安蒂”的狙击之下。
初登场：剧场版M13 漆黑的追踪者（就1次）
声优：干本雄之
姓名：冈仓正明（死亡）
简述：组织间谍（NOC），卷入了一起杀人案被杀害。
初登场：第十三部剧场版——漆黑的追踪者（未正式登场，只是作为被害人被提到）基尔
卧底
基尔（KIR キール）
姓名：本堂瑛海
化名：水无怜奈
年龄：27岁
简述：CIA特工，为破坏组织而打入内部。她的父亲伊森·本堂也是侦办组织的CIA特工，在女儿身份暴露后自杀，并伪造成审问基尔却反被她所杀的假象，使本堂瑛海躲过了组织的怀疑并得到“那位先生”的信任。她平时的身份是日卖电视台的主持人。在一次暗杀政要的行动中因为事故被FBI当作组织成员擒获，并一直在医院伪装昏迷。直到她“苏醒”后FBI才知道她的真实身份，并且将她送回组织继续完成任务。但在刚回去不久时，在琴酒的要求下杀死了赤井秀一，打穿了秀一的肺部。不过很多人怀疑这只是做给琴酒的戏而已。当然琴酒也不是傻瓜拉，赤井连琴酒他都干不掉，单单一个水无怜奈就让他挂掉？
初登场：TV：425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：三石琴乃
黑麦威士忌（RYE ライ，失踪，下落不明！！）
赤井秀一姓名：赤井秀一（あかい しゅういち akai shuichi）
化名：诸星大（代）
年龄：不详。推测大约为28—30
爱车：雪弗莱C1500（黑色皮卡）
简述：FBI中最忌惮的搜查官（在500前后集的水无说过，照搬），曾经在黑衣组织卧底，得到BOSS的赏识获得代号黑麦威士忌。以青山刚昌偶像红色彗星“夏亚”为原型创作的人物，宫野明美的男友，为进入组织曾接近明美，不过假戏真做陷入情网，后无奈与其分手，似与明美的妹妹志保有很深的关系。作为卧底在组织待过三年，逐渐崭露头角成为重要骨干成员，又因FBI安德鲁·卡迈尔的失误被迫逃离组织，之后回到纽约，追击VERMOUTH，与黑组织的几次交手都呈现较大的优势，多次从枪口下救出灰原、柯南、毛利、JUDY、JAMES等人，组织BOSS及GIN认为他是可以射穿黑组织心脏的银色子弹（SILVER BULLET），是一个头脑一级，身手一级，枪法一级的人。平时总戴黑色针织帽，（492集受伤时没有戴），和GIN同为左撇子。在漫画单行本57—58与组织会击，为保护水无怜奈的卧底身份不被泄漏壮烈牺牲。不过大多数人认为这不过是个幌子，是青山掩人耳目的一招。File。622初登场的大学生冲矢昴，因为一些原因被认为可能是赤井秀一假扮的。于File。677登场，他的右脸上留下一块烧伤的疤！疑是在当时他的汽车在爆炸时被烧伤的！赤井秀一还活着这件事恐怕就只有朱蒂老师知道（她也是在677话时才知道的），水无怜奈想必也应该知道！具体情况还有待观察！
外围成员
宫野明美（死亡）
化名：广田雅美
年龄：24-25 岁
简述：宫野志保的姐姐，黑暗组织的基层成员，赤井秀一的女朋友。参与了黑暗组织10亿元抢劫案，得手后因背叛组织被琴酒所杀。和妹妹志保不同，因为是基层成员，所以可以像正常人一样生活，但其实是在组织的监控下。是为了让志保脱离组织，作为交换条件，才加入组织的。为了逃避组织的追查，自己有一间秘密住所，后被组织侦知。为了自己和妹妹能够脱离组织，参与了抢劫10亿元的案件，最后被Gin杀死。
初登场：漫画：Vol。2 File。6 《追踪高大的男人》TV：013 奇怪的寻亲事件
（很多次出现都在回忆中）
剧场版：《通往天国的倒计时》被哀提及。
声优：玉川纱己子（赤井秀一配音池田秀一的妻子）
邵渊己一郎（死亡）
简述：组织底层人物之一，组织的一员，是末端的末端的人物，制造了一系列的连环杀人案。组织教他一系列的杀人手法，以协助优秀的杀手作案。但是他达不到预期的培养效用， 就被送到宫野志保处来作实验对象。后来在作人体实验前逃跑。最后被警察逮捕，并判了死刑。
初登场：漫画：Vol。19 File。7 《钱包疑云》TV：118 浪花连续杀人事件
楠田陆道（死亡）
简述：12月19日假装颈椎扭伤入院，其实是黑衣组织的成员，安排在杯户中央医院寻找基尔的眼线。被FBI发现而驾车逃亡，发觉追踪者是赤井秀一后举枪自杀。
初登场：漫画：Vol。57 File。10 《第2条线索》 TV：496 红与黑的碰撞 入侵
组织协助者
中岛英明（貌似还活着）
性别：男
简介：他与黑衣组织的龙舌兰进行过交易，组织用高价从他手里买了一些偷来的程序。但是龙舌兰拿错了箱子后被误炸死，这次交易没有成功。柯南忠告他最好和警方合作，争取得到警方的保护。他的后续内容没有再交代。
初登场：漫画：Vol。12 File。4 《突如其来的遭遇》TV：054 电玩公司杀人事件
板仓卓（死亡）
性别：男
简述：与龙舌兰接触过的电脑游戏工程师，被胁迫制作一种系统软件，卷入杀人案被害。
初登场：TV：307没有声音的证词
原佳明（死亡）
性别：男
年龄：32
简述：日本的游戏工程师。因为入侵黑衣组织电脑而被GIN所杀害。
初登场：第五部剧场版——通往天国的倒计时。（只1次）
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